В XVI в. в Москве и других городах России развернулось большое крепостное строительство.
Мощнейшей крепостью был Московский Кремль.
В регентство Елены Глинской в Москве построили ещё одну кирпичную крепость — Китай-город, а в конце XVI в., в царствование Фёдора Ивановича, Борис Годунов приказал возвести третью каменную линию укреплений — Белый город (кирпичные стены крепости побелили), которая шла на месте современного Бульварного кольца.
Строительством руководил «государев мастер» Фёдор Конь.
Смоленская крепостная стена протяжённостью около 6 км является грандиозным оборонительным сооружением. Для её возведения пришлось остановить каменное строительство фактически во всей стране.
Строили спешно — в 1603 г. истекало 12-летнее перемирие с Речью Посполитой. Укрепления возводились с учётом новаций в военном деле. 38 башен, обеспечивавших плотный перекрёстный огонь, крепкие стены с несколькими рядами бойниц на прочном фундаменте, «слухи» против подкопов — всё пошло в дело, превращая Смоленск в неодолимую преграду на пути к Москве.
Неприступной крепостью стал Псковский кремль (Кром).
Его каменные стены были воздвигнуты местными мастерами из камня (песчаника) во второй половине XIII в.
В XVI в. Псков достраивался и укреплялся. Несмотря на неоднократные осады, он ни разу не был взят штурмом.
Каменные крепости имелись также в Изборске, Ивангороде (напротив ливонской Нарвы), в Великом Новгороде, Нижнем Новгороде, Туле, Коломне, Можайске.
В большинстве русских городов XVI в. стояли деревянные крепости, которые в то время ещё не потеряли военного значения.
После включения Поволжья в состав России в Казани и Астрахани по царскому указу появлялись свои кремли, созданные русскими зодчими. Стенами обносились и монастыри.